Несколько сайтов на одной БД

плохое ограничение, база иногда растет как на дрожжах.

именно этот самый рост дает нагрузку на сервак... а если пользователю дано ограничение на потребляемые ресурсы загрузки проца, оперативы и т.п. - то тут деваться не куда: или искать другой хост или переезжать на сервак

Домены на одном сервере? если нет, есть ли возможность подключения к базе любого домена откуда-то?

что мешает во время регистрации записать в другие базы инфу?

а вот это лишнее...